摘要

与血管内皮的SARS-CoV-2相关的血栓事件仍不清楚。当前研究的目的是利用计算机模型确定(眼)血管内皮表面的细胞蛋白与SARS-CoV-2引发的免疫血栓形成和/或内皮病变过程之间的关系。本研究将SARS-CoV-2的结构S(刺突糖蛋白)、N(核衣壳蛋白)、M(膜蛋白)、E(包膜蛋白)蛋白、辅助蛋白(ORF1ab)以及与视网膜血管内皮细胞表面或结构相关的158种细胞蛋白进行三维(3D)结构和序列比较。69个视网膜蛋白是从Uniprot数据库中获得的。数据库中未包含的其余蛋白质在使用RaptorX网络工具转换成3D结构后被纳入研究。与mTM-align server比较SARS-COV-2 S、N、M、E、ORF1ab蛋白和视网膜血管内皮蛋白的序列和三维结构。在TM-align web服务器上验证具有显著相似性(评分大于0.5)的蛋白质。用CABS-dock检测相似蛋白的免疫和血栓相关蛋白受体相互作用。我们发现E蛋白与ACE、ACE2、LAT1和TM9SF4内皮蛋白之间存在高度的结构相似性。此外，PECAM-1在结构上与ORF1ab和S蛋白相似。当我们评估刺激免疫反应/细胞因子释放的可能性/潜力时，对SARS-CoV2高度敏感的TLR-2和TLR-3显示出与视网膜血管内皮蛋白潜在的受体-蛋白相互作用。我们的研究表明，SARS-CoV-2蛋白可能与血管内皮蛋白具有结构相似性，因此，作为免疫靶点，许多器官内皮表面的对应蛋白也可能受到针对SARS-CoV-2结构蛋白的免疫应答的继发性影响。

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